中国人民解放军第二军医大学第三附属医院（东方肝胆外科医院，东方肝胆外科研究所），是在我国肝胆外科开拓者、著名肝胆外科专家、中国科学院院士吴孟超教授领导下，从 1958 年成立肝胆外科三人小组开始，经过 40 多年的自力更生、艰苦奋斗、奋发图强、勇攀高峰，由一个小组发展到集医、教、研为一体的院、所合一国内惟一的专科医院，已成为国家重点学科，国家级继续医学教育基地，全军肝胆外科专科中心，全军肝胆外科研究所，全军重点研究所，军队重中之重建设学科，上海市医学领先专业重点学科，上海市临床医学中心。 1993 年 5 月，原中共中央总书记、国家主席、中央军委主席江泽民亲笔提写院名、所名。 1996 年 12 月被总后勤部批准为三级甲等专科医院，拥有 660 张床位和先进的仪器设备。东方肝胆外科医院长期坚持医、教、研相结合，在原发性肝癌的早期诊断和治疗，中晚期肝癌的综合治疗，原发性肝癌术后抗复发治疗，肿瘤的免疫治疗、介入治疗，复杂胆道疾病的手术治疗，肝胆疾病的内窥镜治疗，以及肝移植等方面均居国内外先进水平。不仅采用传统的外科手术治疗方法，还采取了微波方法、射频方法、氩氦刀方法、激光光敏技术、肝内肿瘤酒精注射疗法和经股动脉至肝动脉插管加栓塞疗法等。现年门诊量７万多人次，年收治住院病人 11000 多人次。至 2004 年 12 月止，吴孟超率领同事们已成功实施肝脏切除手术近 17000 例，积累了国际上最大宗的肝癌病例库和标本库，手术成功率达到 98.5% ，术后 5 年总生存率达 48.6% ，小肝癌术后 5 年生存率达 79.8% ，术后生存时间最长的已达 40 年，病人至今健在。肝癌切除例数、切除率、生存率等指标均处于国际领先水平。 1996 年成功施行肝移植 5 例，最小的病人年仅 9 岁。除 1 例术后半年，因原有的肝炎急性发作导致暴发性肝炎死亡外，其他 4 例均得以长期生存，最长已健康生活了 8 年，今年已大学毕业。目前肝移植已成为该院常规治疗方法之一。近 5 年来，收治复杂胆管损伤及高位胆管狭窄病人 620 人次，施行术后复杂肝胆管结石的系列化手术治疗 1930 例，收治高位胆管癌近 251 例，其治疗效果均处国内先进水平。东方肝胆外科医院拥有一支由吴孟超院士领衔，以拔尖中青年为骨干的优秀科技干部队伍，现有高级职称 56 名，博士生导师 16 名，硕士生导师 12 名。 
1996 年 1 月，中央军委授予吴孟超模范医学专家荣誉称号。医院先后有 1 人入选长江学者奖励计划特聘教授， 2 人入选国家百千万人才工程， 1 人获中国有突出贡献博士， 1 人获全国巾帼建功标兵； 4 人获全军育才奖银奖， 2 人获总后一代名师、 1 人获总后科技金星、 2 人获总后科技银星、 2 人获总后科技新星； 3 人获上海市科技精英称号， 3 人获上海市银蛇奖， 1 人获上海市育才奖， 2 人入选上海市百人计划。